Una parte importante del lavoro di GnB è certamente legato alla produzione video, soprattutto per quel che riguarda l'animazione. Questi sono stati proiettati in più occasioni (una serie scelta, ad esempio, venne esposta nel 2012 all'interno della mostra Giona Bernardi, l'uomo e l'artista, presso la galleria Cacticino). Altri materiali di questo genere sono invece inediti o non conclusi. Va anche ricordato il lungo video GnB, una sorta di film-autoritratto nel quale Giona mostra uno spaccato della propria condizione esistenziale.